Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA2P26232 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms