Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms