Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKACBP22694 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms