Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNNI3P19429 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms