Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHCEP18577 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHCEP18577 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHCEP18577 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHCEP18577 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHCEP18577 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHCEP18577 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms