Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS1P17812 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms