Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD1P17405 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms