Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAV1P15498 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAV1P15498 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAV1P15498 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VAV1P15498 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAV1P15498 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms