Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms