Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP3P12645 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP3P12645 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BMP3P12645 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms