Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2AP11388 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2AP11388 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2AP11388 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2AP11388 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2AP11388 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2AP11388 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
TOP2AP11388 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
TOP2AP11388 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2AP11388 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2AP11388 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2AP11388 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms