Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms