Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms