Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFLP07196 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFLP07196 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFLP07196 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms