Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCAP05165 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCAP05165 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCCAP05165 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCCAP05165 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCAP05165 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCAP05165 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCAP05165 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms