Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms