Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JRKO75564 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JRKO75564 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JRKO75564 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JRKO75564 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms