Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms