Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA3O75145 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms