Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms