Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBDO15205 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBDO15205 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBDO15205 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms