Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBTB39O15060 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms