Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2SURPO15042 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms