Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GOLGA8SH3BPF8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms