Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A8MVJ9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A8MVJ9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A8MVJ9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A8MVJ9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A8MVJ9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms