Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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USP17L5A8MUK1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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USP17L5A8MUK1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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USP17L5A8MUK1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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USP17L5A8MUK1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L5A8MUK1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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