Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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