Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms