Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMX2A2RU54 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms