Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX10Q9Y5X0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX10Q9Y5X0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms