Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms