Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms