Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms