Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms