Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4Q9UBX2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms