Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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