Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF7Q9UBF6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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