Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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