Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms