Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms