Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC52A2Q9HAB3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms