Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms