Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms