Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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