Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

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Length 3,911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AKAP9Q99996 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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