Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms