Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC5LQ99459 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms