Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMKK2Q96RR4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMKK2Q96RR4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms