Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC85AQ96PX6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms