Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms